涵洞式水闸 是指进口装设闸门、门后为涵洞的水闸，又称封闭式水闸或涵管式水闸。涵洞式水闸常用于水位较高、孔口尺寸较小的水闸，过闸水流受低水位控制。穿堤取水的进水闸、分水闸以及穿堤排水的排水闸等都属涵洞式。由于洞身上部填土可以作为路基，不需另设交通桥，两岸连接结构较开敞式水闸简单，因而较经济。涵洞式水闸由进口、洞身和出口连接段3部分组成。闸门设在进口（见图）。进口首部的工作特点和设计方法与涵洞相似。洞身结构型式有圆涵、盖板涵、箱涵和拱涵4种。根据洞身内水流流态分为有压涵洞式水闸和无压涵洞式水闸两种，前者的洞身宜采用箱涵或圆涵；后者的洞身可采用盖板涵或拱涵。

涵洞式水闸的特点：①靠填土挡水，闸基、堤身防渗需统一考虑。②涵洞内的水流流态随闸前水位而变，同一水闸，洞内可能出现有压流、无压流和半有压流等不同流态，设计时力求呈现一种流态。③洞身上部填土高度不等，荷载沿洞身分布不均，洞身需适当分段，设置沉降缝和止水设备，防止不均匀沉降危及洞身的安全。

        涵洞式水闸在运用过程中常见的问题：①洞身因纵向强度不够，在上部不均匀荷载作用下发生断裂，因此需合理选择分缝位置，适当缩短分缝距离，加强洞身纵向配筋。②洞身中间沉降大，两端沉降小，出口段易形成倒坡而泄水不畅，故需根据沉降计算结果适当提高中间段洞身的底部高程。③为避免洞身接缝错动，使止水断裂而导致漏水，常需在接缝处设置加劲环。④为防止沿洞身外侧发生接触冲刷，必要时需设置截渗环（可与加劲环结合）或防渗齿墙。⑤从多沙河流引水的涵洞式水闸，洞内常有淤积，宜适当加大洞身纵坡以增大洞内流速，防止淤积。